More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2084 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  100 
 
 		 393 aa  778    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  68.31 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  61.28 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  60.37 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  56.99 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  56.68 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  54.12 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  52.45 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  50.76 
 
 		 415 aa  345  7e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  51.63 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  49.49 
 
 		 435 aa  342  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  52.46 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.8 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  53.89 
 
 		 412 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  48.92 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  50.28 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  47.45 
 
 		 398 aa  289  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  47.51 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  49.34 
 
 		 465 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  49.26 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  48.18 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  50.14 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  52.59 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  46.63 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  57.85 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  50.8 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  49.66 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  50.8 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  50.8 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  54.62 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  43.51 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  50.66 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  41.41 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  41.84 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  46.33 
 
 		 483 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  46.38 
 
 		 257 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 582 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  45.17 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  44.3 
 
 		 584 aa  182  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  37.37 
 
 		 587 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  37.37 
 
 		 587 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  37.37 
 
 		 587 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  37.37 
 
 		 587 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  37.37 
 
 		 587 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 556 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  37.04 
 
 		 587 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 489 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.04 
 
 		 587 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 592 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 585 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.36 
 
 		 587 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  38.64 
 
 		 575 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.36 
 
 		 587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  40.59 
 
 		 599 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 571 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 589 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  35.56 
 
 		 565 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  39.41 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  43.15 
 
 		 591 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  36.54 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  37.39 
 
 		 363 aa  170  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 429 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  38.96 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 584 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 584 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.65 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 587 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  34.29 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 581 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  34.06 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  37.87 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.87 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  32.95 
 
 		 551 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  37.87 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.87 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  37.87 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  37.87 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  37.87 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  37.23 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 590 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  32.87 
 
 		 555 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  37.13 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  40.87 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  37.82 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  38.74 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>