More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0895 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  100 
 
 
435 aa  833    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  56.52 
 
 
412 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  55.67 
 
 
392 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  53.71 
 
 
397 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  53.77 
 
 
391 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  55.45 
 
 
423 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  52.89 
 
 
387 aa  347  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  49.74 
 
 
393 aa  340  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  52.29 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  52.27 
 
 
394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  47.85 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  49.41 
 
 
422 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  51.44 
 
 
391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  52.82 
 
 
377 aa  326  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  48.95 
 
 
409 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  45.54 
 
 
415 aa  299  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  51.12 
 
 
465 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  47.94 
 
 
414 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  47.68 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  51.3 
 
 
425 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  51.2 
 
 
384 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  51.17 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  53.01 
 
 
416 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  48.09 
 
 
382 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 
401 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  43.12 
 
 
397 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  54.33 
 
 
394 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  50.81 
 
 
401 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  50.4 
 
 
402 aa  236  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  45.76 
 
 
410 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
443 aa  233  5e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  46.57 
 
 
425 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  49.22 
 
 
392 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  49.22 
 
 
392 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  49.22 
 
 
392 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  49.46 
 
 
483 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  40.2 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  48.39 
 
 
257 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  45.76 
 
 
347 aa  186  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
582 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
439 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  40.83 
 
 
439 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  39.92 
 
 
599 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  40.14 
 
 
439 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  40.14 
 
 
439 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
445 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  41.67 
 
 
346 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 
581 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  41.86 
 
 
433 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
429 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.68 
 
 
587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
581 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
584 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
458 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  36.68 
 
 
587 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
571 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
587 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
584 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.68 
 
 
587 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.68 
 
 
587 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.68 
 
 
587 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.68 
 
 
587 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.68 
 
 
587 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.68 
 
 
587 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  39.77 
 
 
581 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.68 
 
 
587 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
346 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 
460 aa  166  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  39.38 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  39.38 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
585 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  38.18 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  39.64 
 
 
438 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
437 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  39.78 
 
 
436 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  40.14 
 
 
436 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  37.6 
 
 
430 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  39.15 
 
 
446 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  40.14 
 
 
436 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  40.14 
 
 
436 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  40.14 
 
 
436 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  40.14 
 
 
436 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  40.14 
 
 
436 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  40.14 
 
 
448 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  37.16 
 
 
436 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
377 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
376 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
437 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  36 
 
 
565 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
440 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  36.73 
 
 
440 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  39.84 
 
 
584 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  36.3 
 
 
440 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  37.59 
 
 
437 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>