More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0470 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  100 
 
 		 425 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  77.13 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  52.75 
 
 		 412 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  53.76 
 
 		 414 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  51.73 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  52.35 
 
 		 397 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  55.37 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  49.85 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  49.13 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  51.52 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  52.57 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  50 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  51.16 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  49.85 
 
 		 393 aa  285  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  53.45 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  50.96 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  45.7 
 
 		 401 aa  279  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  46.53 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  49.7 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  49.55 
 
 		 415 aa  269  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  50.55 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  50.57 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  46.38 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  52.26 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  46.38 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  46.38 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  48.55 
 
 		 409 aa  265  8e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  48.25 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  46.52 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  45.94 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  46.61 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  48.73 
 
 		 394 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  51.31 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  40.88 
 
 		 347 aa  206  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  43.73 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  44.94 
 
 		 581 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  47.35 
 
 		 257 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 581 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 571 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  40.68 
 
 		 584 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  44.13 
 
 		 581 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 584 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  36.15 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 608 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  37.54 
 
 		 537 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 609 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 585 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 590 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 596 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 600 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 592 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 611 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.69 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 453 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 460 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 619 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 587 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  42.92 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  35.71 
 
 		 613 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  33.24 
 
 		 599 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  35.28 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 589 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  41.98 
 
 		 346 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 346 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2215  histidine kinase  38.3 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 599 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  38.79 
 
 		 346 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 607 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.86 
 
 		 587 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  29.86 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 591 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  34.99 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>