More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0403 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  100 
 
 		 425 aa  821    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  89.24 
 
 		 410 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.43 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  49.57 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  52.26 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  47.18 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  51.86 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  50.76 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  47.65 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  48.76 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.85 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  41.41 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  43.85 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  48.16 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  44.72 
 
 		 416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  48.11 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  46.33 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  46.86 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  43.58 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  52.23 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  43.15 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  44.79 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  49.69 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  46.86 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  51.63 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  43.28 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  43.21 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  52.34 
 
 		 397 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  50.81 
 
 		 401 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  45.94 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  49.59 
 
 		 257 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  40.3 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  49.8 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  48.16 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  48.16 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  48.16 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  47.73 
 
 		 483 aa  186  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 582 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 590 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  39.77 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  40.08 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  39.24 
 
 		 565 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  35.74 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  36.59 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 584 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 597 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  40.33 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 599 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  34.42 
 
 		 587 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  45.08 
 
 		 591 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 585 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  34.42 
 
 		 587 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.42 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 585 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 584 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  33.55 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  33.55 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  33.55 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  37.73 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  33.55 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  38.1 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  38.1 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  38.1 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  38.1 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  40.08 
 
 		 443 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  38.1 
 
 		 436 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 587 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 608 aa  159  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  37.36 
 
 		 431 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 594 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  39.26 
 
 		 584 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 589 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 608 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 607 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  37.73 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  34.09 
 
 		 587 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  34.09 
 
 		 587 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  36.98 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.73 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  36.98 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  36.98 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  39.09 
 
 		 599 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>