More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0569 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
474 aa  944    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  77.33 
 
 
473 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  94.51 
 
 
474 aa  867    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  70.13 
 
 
472 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  70.34 
 
 
477 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  70.19 
 
 
478 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  69.77 
 
 
478 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  51.59 
 
 
481 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  50.21 
 
 
483 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  50 
 
 
483 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  50 
 
 
483 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  50 
 
 
483 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  50.21 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  49.06 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  48.73 
 
 
474 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  48.52 
 
 
474 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  49.36 
 
 
472 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  48.31 
 
 
474 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  48.1 
 
 
474 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  48.52 
 
 
474 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  48.52 
 
 
474 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  48.31 
 
 
474 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  48.31 
 
 
474 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  48.1 
 
 
474 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  46.34 
 
 
474 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  48.95 
 
 
474 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  47.05 
 
 
474 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  47.47 
 
 
477 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  47.05 
 
 
474 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  47.47 
 
 
477 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  47.05 
 
 
474 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  47.26 
 
 
474 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  47.26 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  46.62 
 
 
474 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  46.64 
 
 
486 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  45.32 
 
 
477 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 
476 aa  363  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  39.79 
 
 
475 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  44.35 
 
 
483 aa  359  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  43.19 
 
 
465 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  41.34 
 
 
486 aa  345  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  40.68 
 
 
478 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  40.76 
 
 
480 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  40.41 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  34.16 
 
 
628 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  41.88 
 
 
239 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
467 aa  136  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
616 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  30.19 
 
 
616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  30.19 
 
 
616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  24.14 
 
 
456 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  27.89 
 
 
464 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  24.67 
 
 
463 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 
613 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  24.28 
 
 
463 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  21.97 
 
 
471 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  24.67 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  24.67 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  23.8 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  24.31 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
615 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  26.23 
 
 
466 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  21.62 
 
 
471 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  26.09 
 
 
466 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  24.6 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
564 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  24.59 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25.34 
 
 
458 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.87 
 
 
468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
462 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  23.8 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  23.89 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  23.93 
 
 
463 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  36.25 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.66 
 
 
458 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.02 
 
 
466 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.62 
 
 
486 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  25.39 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  24.14 
 
 
467 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  24.66 
 
 
458 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  24.32 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
487 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  25.39 
 
 
466 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  24.32 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.32 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  25.55 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  25.55 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.66 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  24.66 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  28 
 
 
541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 
614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  25.55 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  25.55 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>