More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4325 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  100 
 
 		 541 aa  1083    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 		 674 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3336  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 526 aa  226  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6329  histidine kinase  41.45 
 
 		 340 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00201026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 335 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 538 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  28.27 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  26.25 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 486 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.34 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  28.48 
 
 		 455 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  29.6 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  28.32 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 487 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.34 
 
 		 462 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  28 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 488 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 639 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  29.16 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  29.16 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  28.78 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  30.3 
 
 		 463 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 493 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  24 
 
 		 310 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  28.57 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.19 
 
 		 1162 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 		 470 aa  97.4  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 466 aa  97.4  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  25.98 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  27.03 
 
 		 494 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  30.97 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  27.09 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  29.39 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  30.66 
 
 		 328 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  30.68 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 640 aa  94.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  29.1 
 
 		 343 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  26.82 
 
 		 474 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 467 aa  94.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 458 aa  94.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  27.03 
 
 		 477 aa  94.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 641 aa  94  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  26.77 
 
 		 483 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  26.77 
 
 		 483 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  26.77 
 
 		 483 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  23.99 
 
 		 473 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 462 aa  94  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  30.03 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  32.89 
 
 		 473 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 349 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  30.13 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 639 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 356 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 639 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  30.13 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  30.13 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  30.6 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  29.72 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  29.07 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  27.42 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  30.48 
 
 		 490 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 462 aa  91.3  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 466 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  26.92 
 
 		 483 aa  91.3  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  31.08 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 478 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  29.47 
 
 		 486 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 466 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  29.54 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.25 
 
 		 468 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  29.54 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 477 aa  90.5  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  29.54 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  29.54 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  29.54 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 463 aa  90.1  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.66 
 
 		 454 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 589 aa  90.1  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 493 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  25.69 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  31.12 
 
 		 594 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  25.69 
 
 		 482 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  25.58 
 
 		 481 aa  90.1  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  26.1 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 466 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  25.69 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 493 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  25.69 
 
 		 482 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  26.75 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>