More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3125 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  100 
 
 		 490 aa  969    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  46.1 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  38.82 
 
 		 476 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.86 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  41.54 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.21 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  38.99 
 
 		 480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 475 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  35.75 
 
 		 469 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  37.64 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 464 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  33.12 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  34.4 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 490 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.88 
 
 		 472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  30.72 
 
 		 505 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  45.1 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  37.94 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  40 
 
 		 453 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 586 aa  163  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  37.63 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  37.28 
 
 		 442 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.91 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  31.73 
 
 		 452 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.74 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.93 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 498 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.54 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.72 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.02 
 
 		 503 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.87 
 
 		 469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  32.12 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  31.27 
 
 		 405 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 484 aa  146  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 504 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204488  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  35.88 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  29.71 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  35.79 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  35.48 
 
 		 561 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  34.49 
 
 		 555 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  35.35 
 
 		 561 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 515 aa  136  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.65 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  32.65 
 
 		 379 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  36.19 
 
 		 566 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.12 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  38.49 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  31.78 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 524 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  36.46 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  29.9 
 
 		 520 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 513 aa  130  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  36.51 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 495 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  33.12 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  36.27 
 
 		 583 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 473 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 473 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>