More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4586 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
335 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6329  histidine kinase  88.06 
 
 
340 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00201026  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 
674 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  41.91 
 
 
541 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3336  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
520 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
526 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179224  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  30.48 
 
 
455 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  28.9 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  28.86 
 
 
351 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  33.1 
 
 
476 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
351 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  29.19 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  29.48 
 
 
357 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  28.28 
 
 
351 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  28.28 
 
 
351 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  28.49 
 
 
347 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  30.13 
 
 
475 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32.89 
 
 
591 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
605 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
464 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
363 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  32.41 
 
 
478 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
607 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  33.46 
 
 
483 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  33.46 
 
 
483 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
455 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  33.46 
 
 
483 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.07 
 
 
310 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.83 
 
 
473 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
578 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 
349 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27.81 
 
 
455 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27.81 
 
 
455 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
614 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
253 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
589 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  25.84 
 
 
430 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  32.92 
 
 
673 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  29.73 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  31.84 
 
 
555 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.13 
 
 
456 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
425 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.4 
 
 
467 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
491 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  25.59 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  31.37 
 
 
475 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
491 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  34.8 
 
 
555 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
563 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  32.89 
 
 
596 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
442 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
442 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
442 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2307  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
666 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  29.79 
 
 
591 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  28.38 
 
 
503 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
641 aa  96.7  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
605 aa  96.3  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
596 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  33.47 
 
 
442 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
410 aa  95.9  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
442 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.44 
 
 
463 aa  95.9  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
442 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
616 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
674 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  29.04 
 
 
601 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.44 
 
 
463 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
487 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
611 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
585 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
481 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.33 
 
 
463 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.44 
 
 
463 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  25.5 
 
 
458 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
484 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  30.97 
 
 
575 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  32.22 
 
 
483 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.19 
 
 
499 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
462 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
591 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  30.49 
 
 
599 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
463 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
381 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0982529  normal  0.120585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
484 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>