More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2013 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 410 aa  815    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  40.1 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  37.25 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  44.85 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  37.44 
 
 		 408 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  42.71 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 440 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  43.18 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  30.17 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 563 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 453 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  33.16 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  28.12 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  28.18 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  28.12 
 
 		 433 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  28.18 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  28.18 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  28.18 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  28.12 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  28.12 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  31.74 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  28.34 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  27.66 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  28.67 
 
 		 433 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  36.33 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  36.33 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  36.33 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  28.67 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  35.88 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  28.31 
 
 		 436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  33.1 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  28.67 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  28.44 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.67 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  29.21 
 
 		 461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 461 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2104  histidine kinase  37.7 
 
 		 700 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  29.24 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1821  putative signal transduction histidine kinase sensor  37.7 
 
 		 703 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.982288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 535 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  32.63 
 
 		 538 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  32.65 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  32.98 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 427 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.41 
 
 		 561 aa  126  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 536 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  31.56 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  32.97 
 
 		 480 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  31.4 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  26.77 
 
 		 463 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 546 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 464 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  34.06 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.31 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.46 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  34.15 
 
 		 583 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  28.46 
 
 		 422 aa  123  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  30.74 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3288  histidine kinase  29.79 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000647105  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 550 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  27.67 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  28.07 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  24.94 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000859789  normal  0.518729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>