More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3968 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  82.68 
 
 
590 aa  983    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  64.71 
 
 
601 aa  699    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.62 
 
 
605 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.01 
 
 
578 aa  949    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.77 
 
 
589 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  64.71 
 
 
589 aa  698    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
596 aa  1188    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  97.48 
 
 
596 aa  1140    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  58.61 
 
 
607 aa  608  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.83 
 
 
599 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  54.85 
 
 
611 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.15 
 
 
607 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.82 
 
 
581 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.07 
 
 
602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  56.27 
 
 
605 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.3 
 
 
563 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.82 
 
 
615 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.38 
 
 
566 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.32 
 
 
627 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  53.8 
 
 
616 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  53.8 
 
 
616 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.92 
 
 
611 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.53 
 
 
616 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  55.89 
 
 
605 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.18 
 
 
597 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.46 
 
 
601 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
564 aa  363  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
559 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
549 aa  319  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
574 aa  316  9e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  38.96 
 
 
572 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
577 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  38.8 
 
 
572 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
550 aa  296  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
540 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
572 aa  294  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
529 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
525 aa  256  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
538 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  29.87 
 
 
475 aa  133  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
487 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
489 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  35.44 
 
 
587 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  35.44 
 
 
587 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.29 
 
 
463 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
451 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
621 aa  123  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  25.88 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  26.18 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  26.18 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  34.6 
 
 
587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  25.88 
 
 
458 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
484 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
470 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
587 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  25.88 
 
 
458 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
471 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.29 
 
 
343 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.77 
 
 
496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  34.2 
 
 
613 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
932 aa  120  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  34.18 
 
 
587 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  34.2 
 
 
613 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
484 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
484 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
750 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
484 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  34.18 
 
 
587 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  25.59 
 
 
458 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  34.18 
 
 
587 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  25.59 
 
 
458 aa  120  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  34.18 
 
 
587 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  34.18 
 
 
587 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  25.07 
 
 
458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  33.83 
 
 
613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  33.83 
 
 
613 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  33.46 
 
 
613 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  33.83 
 
 
613 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  26.98 
 
 
617 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  33.83 
 
 
613 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
446 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
470 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.71 
 
 
458 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
473 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.76 
 
 
587 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 
449 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
466 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  33.21 
 
 
613 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>