More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4629 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
559 aa  1097    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 
540 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 
615 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  42.19 
 
 
590 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
578 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
605 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
596 aa  360  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  41.99 
 
 
596 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
616 aa  352  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  42.39 
 
 
616 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  42.39 
 
 
616 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  41.4 
 
 
589 aa  350  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  41.4 
 
 
601 aa  350  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 
597 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
589 aa  346  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  39.15 
 
 
607 aa  345  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
627 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  42.93 
 
 
605 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
601 aa  334  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
611 aa  329  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
605 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
564 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
607 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
602 aa  316  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
611 aa  310  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
566 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
581 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
563 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
599 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 
592 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
574 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
501 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  37.5 
 
 
572 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  37.5 
 
 
572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
577 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
572 aa  239  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
529 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
525 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.41 
 
 
463 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.27 
 
 
456 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.48 
 
 
462 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
463 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
463 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.85 
 
 
461 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.25 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.81 
 
 
463 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
484 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  26.61 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
455 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
455 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
484 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.2 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
484 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
484 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
462 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  26.31 
 
 
475 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
484 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
538 aa  124  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
484 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  29.89 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
383 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
451 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
639 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
473 aa  120  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
310 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
639 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
571 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
346 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  25.69 
 
 
491 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
478 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  35.18 
 
 
257 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.95 
 
 
473 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
483 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.61 
 
 
496 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
406 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
620 aa  115  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  30.72 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  29.6 
 
 
360 aa  114  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
504 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
463 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  25.23 
 
 
482 aa  114  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
504 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
346 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
487 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  30.45 
 
 
719 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.251569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>