More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2564 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  87.82 
 
 		 572 aa  917    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 550 aa  1081    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  87.64 
 
 		 572 aa  915    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.29 
 
 		 572 aa  658    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.47 
 
 		 574 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.35 
 
 		 577 aa  658    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 616 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  40.71 
 
 		 616 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  40.71 
 
 		 616 aa  324  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 578 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  39.29 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 615 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  38.42 
 
 		 589 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 607 aa  309  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  38.07 
 
 		 601 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 605 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 589 aa  302  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  39.05 
 
 		 596 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 596 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 605 aa  296  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 566 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 597 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 564 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 602 aa  281  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 563 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  42.6 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.06 
 
 		 599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  34.27 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 627 aa  264  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 559 aa  240  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 501 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  28.83 
 
 		 466 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  26.22 
 
 		 471 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 641 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 719 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 585 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 613 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  24.78 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  25.86 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 738 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  27.25 
 
 		 719 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 719 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  26.97 
 
 		 722 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 722 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 722 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 719 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.26 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  33.77 
 
 		 581 aa  124  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  27.47 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.58 
 
 		 463 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 581 aa  123  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 614 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 722 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 723 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 687 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 719 aa  121  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 346 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 425 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  22.29 
 
 		 469 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.08 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  23.8 
 
 		 456 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 639 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  24.4 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  24.4 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  31.44 
 
 		 571 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.73 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 581 aa  117  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>