More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1682 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  99.65 
 
 		 572 aa  1124    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.64 
 
 		 550 aa  915    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.67 
 
 		 572 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 572 aa  1126    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.25 
 
 		 574 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.71 
 
 		 577 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  40.64 
 
 		 616 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  40.64 
 
 		 616 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  38.53 
 
 		 590 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 616 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  38.03 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  37.5 
 
 		 601 aa  301  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  38.96 
 
 		 596 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 607 aa  300  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 605 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 611 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 605 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 566 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 581 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 597 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.72 
 
 		 599 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.3 
 
 		 563 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  47.24 
 
 		 605 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  33.97 
 
 		 607 aa  270  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 627 aa  264  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 549 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 540 aa  246  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 592 aa  226  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 529 aa  203  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 525 aa  180  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 487 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 719 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  28.75 
 
 		 466 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  24.78 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 425 aa  127  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 641 aa  126  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 581 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.06 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 719 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  34.21 
 
 		 581 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.19 
 
 		 463 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  28.12 
 
 		 463 aa  124  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 489 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 467 aa  123  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.82 
 
 		 463 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 738 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 585 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 722 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  26.12 
 
 		 722 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 722 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  22.42 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 719 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  26.12 
 
 		 719 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  26.59 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 723 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 722 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  26.87 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 458 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25.35 
 
 		 456 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  25.84 
 
 		 687 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  26.55 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 613 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 354 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 614 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29.79 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  32.18 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 609 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 719 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 453 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 453 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 453 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 468 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  33.05 
 
 		 346 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>