More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0596 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.28 
 
 		 581 aa  919    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  84.63 
 
 		 605 aa  933    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  85.19 
 
 		 611 aa  944    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.08 
 
 		 602 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  88.34 
 
 		 599 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 566 aa  1126    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  88.63 
 
 		 563 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.22 
 
 		 607 aa  951    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.51 
 
 		 616 aa  631  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  60.97 
 
 		 616 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  60.97 
 
 		 616 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60 
 
 		 611 aa  616  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.22 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.54 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.18 
 
 		 627 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.18 
 
 		 578 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  57.04 
 
 		 589 aa  595  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  56.87 
 
 		 601 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  60.95 
 
 		 605 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  57.48 
 
 		 590 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.12 
 
 		 597 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.38 
 
 		 596 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  58.2 
 
 		 596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.12 
 
 		 589 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.16 
 
 		 615 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  53.68 
 
 		 607 aa  522  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 564 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 559 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 550 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 577 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  40.1 
 
 		 572 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  39.93 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 592 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  30.19 
 
 		 475 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 488 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 640 aa  139  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.51 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 489 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1928  histidine kinase  35.16 
 
 		 357 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  35.16 
 
 		 357 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  27.94 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 466 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  25.93 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  35.71 
 
 		 669 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 458 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 458 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 614 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 458 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  30.05 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  27.91 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  35.12 
 
 		 257 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  31.34 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  33.45 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 581 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  26.76 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  33.1 
 
 		 465 aa  120  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 492 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  34.16 
 
 		 363 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 981 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 444 aa  120  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  32.89 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 621 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.74 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  31.03 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30.82 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1409  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  27.08 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.18 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 600 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  31.09 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 453 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  30.18 
 
 		 449 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  31.93 
 
 		 466 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>