More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0226 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  74.17 
 
 		 616 aa  796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 597 aa  1170    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.33 
 
 		 601 aa  751    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  74.17 
 
 		 616 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  93.47 
 
 		 605 aa  1031    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.73 
 
 		 616 aa  798    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  59.6 
 
 		 611 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.81 
 
 		 611 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.36 
 
 		 607 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.07 
 
 		 627 aa  619  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  59.02 
 
 		 605 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.9 
 
 		 581 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.05 
 
 		 563 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.42 
 
 		 599 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.83 
 
 		 602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.61 
 
 		 605 aa  581  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.23 
 
 		 566 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  55.48 
 
 		 590 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  54.78 
 
 		 601 aa  558  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  54.96 
 
 		 589 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  55.36 
 
 		 596 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.18 
 
 		 596 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.73 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.99 
 
 		 589 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  51.59 
 
 		 607 aa  496  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.62 
 
 		 615 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 577 aa  324  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 549 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  37.68 
 
 		 572 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 592 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 529 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 501 aa  241  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 525 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  32.25 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 458 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 640 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 468 aa  137  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  24.81 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 815 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  30.26 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  28.12 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  33.7 
 
 		 343 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  29.66 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  29.66 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  29.66 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 723 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 639 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 473 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  29.04 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 639 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 719 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.41 
 
 		 496 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 538 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  26.08 
 
 		 463 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  26.08 
 
 		 463 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 614 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  26.08 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.6 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  28.35 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  33.53 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 641 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 639 aa  124  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 463 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 614 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.74 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.39 
 
 		 462 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 466 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 461 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 600 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  27.57 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  36.59 
 
 		 669 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 607 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  24.8 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>