More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0045 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  65.08 
 
 		 601 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  100 
 
 		 590 aa  1172    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.68 
 
 		 596 aa  960    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.04 
 
 		 578 aa  942    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.7 
 
 		 589 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.86 
 
 		 605 aa  721    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  65.08 
 
 		 589 aa  694    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  83.59 
 
 		 596 aa  967    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  59.15 
 
 		 607 aa  608  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  57.04 
 
 		 611 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.82 
 
 		 607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.04 
 
 		 602 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.45 
 
 		 599 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.42 
 
 		 581 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.76 
 
 		 563 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.82 
 
 		 611 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.78 
 
 		 615 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.78 
 
 		 627 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  54.95 
 
 		 605 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.48 
 
 		 566 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  54.07 
 
 		 616 aa  535  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.31 
 
 		 616 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  54.07 
 
 		 616 aa  535  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.48 
 
 		 597 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  56.41 
 
 		 605 aa  515  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.04 
 
 		 601 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 564 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 549 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  38.69 
 
 		 572 aa  299  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  38.53 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 540 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 577 aa  297  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 574 aa  297  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 501 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 538 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 467 aa  125  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  27.05 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 640 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.84 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 723 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 487 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 920 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  31.6 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  29.64 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 750 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 607 aa  114  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 446 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 600 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 446 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 466 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  27.72 
 
 		 719 aa  113  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3078  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 886 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.27 
 
 		 508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.02 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  26.78 
 
 		 1111 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  29.8 
 
 		 594 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  29.66 
 
 		 463 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  26.04 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 471 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 602 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 458 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 504 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 473 aa  109  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.63 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 607 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 639 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  32.99 
 
 		 903 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>