More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1883 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 549 aa  1075    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.24 
 
 		 592 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 564 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  40.67 
 
 		 590 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 615 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  40.14 
 
 		 596 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 596 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  36.44 
 
 		 607 aa  320  6e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  36.9 
 
 		 601 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  36.9 
 
 		 589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 601 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  38.55 
 
 		 616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  38.55 
 
 		 616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 616 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 611 aa  297  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 607 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  37.65 
 
 		 605 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 611 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 563 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 627 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 559 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  38.82 
 
 		 572 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  39 
 
 		 572 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 602 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 501 aa  257  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  36.15 
 
 		 423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 467 aa  139  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.44 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 815 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  31.81 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  26.37 
 
 		 617 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  26.37 
 
 		 617 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  24.87 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.7 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  26.49 
 
 		 617 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  28.88 
 
 		 352 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 470 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  35.19 
 
 		 581 aa  123  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  26.89 
 
 		 487 aa  123  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  25.77 
 
 		 609 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 412 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.59 
 
 		 463 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.59 
 
 		 463 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  24.79 
 
 		 620 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 		 539 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  27.04 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  24.87 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  24.94 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1282  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.153514  normal  0.0403413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  34.5 
 
 		 986 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  25.47 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  31.5 
 
 		 477 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 621 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.43 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 493 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  25.67 
 
 		 617 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 582 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 617 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  33.45 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 987 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  34.89 
 
 		 581 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  26.99 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  34.63 
 
 		 356 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  26.99 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  27.46 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.88 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 617 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 639 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 463 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>