More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0368 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.1 
 
 		 616 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  62.05 
 
 		 616 aa  643    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.44 
 
 		 602 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  83.87 
 
 		 611 aa  926    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.74 
 
 		 599 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  88.63 
 
 		 566 aa  930    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 563 aa  1120    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.84 
 
 		 607 aa  920    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  91.47 
 
 		 581 aa  957    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  62.05 
 
 		 616 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  82.8 
 
 		 605 aa  911    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.72 
 
 		 601 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.82 
 
 		 611 aa  618  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.53 
 
 		 627 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  60.88 
 
 		 605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.05 
 
 		 597 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.75 
 
 		 578 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.61 
 
 		 605 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  56.76 
 
 		 590 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.3 
 
 		 596 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  57.02 
 
 		 596 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  55.85 
 
 		 601 aa  579  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  56.02 
 
 		 589 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.77 
 
 		 589 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 		 615 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  52.65 
 
 		 607 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.1 
 
 		 564 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 574 aa  316  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 572 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.61 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  39.65 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  39.48 
 
 		 572 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 592 aa  247  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 501 aa  246  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  29.37 
 
 		 475 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 467 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 466 aa  134  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  33.22 
 
 		 343 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  36.63 
 
 		 257 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 458 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 489 aa  133  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.76 
 
 		 458 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 466 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.1 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29.33 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.93 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.2 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  30.31 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  30.28 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 719 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.59 
 
 		 461 aa  120  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.59 
 
 		 461 aa  120  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 469 aa  120  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  26.46 
 
 		 719 aa  120  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  32.35 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  32.35 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.35 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  32.35 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 600 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.35 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.35 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  32.04 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 719 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 585 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 652 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 451 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 719 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  35.05 
 
 		 669 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  29.35 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 738 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>