More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0464 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  91.21 
 
 		 581 aa  984    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  79.21 
 
 		 611 aa  933    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.43 
 
 		 602 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  79.02 
 
 		 605 aa  926    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 599 aa  1196    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  88.34 
 
 		 566 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.74 
 
 		 563 aa  1003    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  80.13 
 
 		 607 aa  938    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.79 
 
 		 616 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  60.03 
 
 		 616 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  60.03 
 
 		 616 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.34 
 
 		 601 aa  621  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.29 
 
 		 611 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.18 
 
 		 627 aa  615  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.73 
 
 		 578 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  56.83 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.83 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.4 
 
 		 605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  56.45 
 
 		 590 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  59.66 
 
 		 605 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.42 
 
 		 597 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  55.75 
 
 		 589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  55.57 
 
 		 601 aa  572  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.06 
 
 		 589 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.56 
 
 		 615 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  52.63 
 
 		 607 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 564 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 574 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.03 
 
 		 559 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 572 aa  301  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 		 577 aa  300  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 540 aa  300  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  39.27 
 
 		 572 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 550 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  39.09 
 
 		 572 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 525 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 501 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 		 529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  29.29 
 
 		 475 aa  136  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 467 aa  134  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 458 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 458 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 458 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 458 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 489 aa  128  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  32.44 
 
 		 343 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.49 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  27.79 
 
 		 458 aa  123  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.76 
 
 		 491 aa  123  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 640 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  28.44 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  26.49 
 
 		 463 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.61 
 
 		 496 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.17 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  34.57 
 
 		 257 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.17 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 463 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 471 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 463 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 463 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.22 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 470 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 463 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 463 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  29.75 
 
 		 506 aa  120  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 453 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  28.22 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.07 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 719 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  25.91 
 
 		 719 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 		 1133 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.45 
 
 		 512 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 885 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 652 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.99 
 
 		 467 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  31.99 
 
 		 467 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.99 
 
 		 467 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  31.99 
 
 		 467 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 463 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>