More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0211 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  66.85 
 
 		 572 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  66.67 
 
 		 572 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 572 aa  1134    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.29 
 
 		 550 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.13 
 
 		 577 aa  630  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.75 
 
 		 574 aa  626  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  42.25 
 
 		 616 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  42.25 
 
 		 616 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 616 aa  339  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 615 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 578 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 602 aa  317  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  40.28 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 611 aa  307  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  41.01 
 
 		 605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 596 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 611 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  38.97 
 
 		 596 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 597 aa  300  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 627 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  38.69 
 
 		 589 aa  293  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  38.34 
 
 		 601 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 564 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 566 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.24 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 599 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 563 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  43.09 
 
 		 607 aa  259  9e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 540 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 549 aa  250  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 592 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 529 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  25.23 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.28 
 
 		 463 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.28 
 
 		 463 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  28.31 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 608 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.95 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.87 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 609 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 581 aa  123  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.37 
 
 		 461 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  24.17 
 
 		 722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 719 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 723 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 585 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  33.77 
 
 		 581 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 723 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  32.75 
 
 		 465 aa  122  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 425 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  32.77 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  32.77 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 722 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.9 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.97 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  23.95 
 
 		 719 aa  120  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 719 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  24.5 
 
 		 719 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.5 
 
 		 446 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  24.17 
 
 		 687 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  27.21 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 719 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  26.99 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 458 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>