More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1790 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.33 
 
 		 738 aa  1165    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.43 
 
 		 722 aa  1082    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3981  sensor histidine kinase  49.93 
 
 		 738 aa  697    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  71.55 
 
 		 687 aa  1034    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.71 
 
 		 719 aa  1090    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.57 
 
 		 722 aa  1083    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.62 
 
 		 725 aa  1189    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355217  normal  0.132598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 723 aa  1497    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03558  putative sensor histidine kinase  48.61 
 
 		 722 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.57 
 
 		 722 aa  1081    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.5 
 
 		 750 aa  738    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2519  histidine kinase  77.42 
 
 		 728 aa  1176    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  72.26 
 
 		 719 aa  1092    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  71.98 
 
 		 719 aa  1091    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  72.22 
 
 		 723 aa  1089    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  71.43 
 
 		 722 aa  1082    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  72.12 
 
 		 719 aa  1093    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  65.56 
 
 		 719 aa  978    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1015  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 690 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 678 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1202  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.868764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 572 aa  121  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 605 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 564 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 616 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 577 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 615 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  26.32 
 
 		 589 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  26.11 
 
 		 616 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  26.11 
 
 		 616 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  26.04 
 
 		 601 aa  110  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  27.44 
 
 		 572 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 578 aa  107  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 572 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 529 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 		 597 aa  105  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 627 aa  104  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  25.8 
 
 		 605 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 559 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 525 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 465 aa  99.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.82 
 
 		 614 aa  99  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 504 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  23.5 
 
 		 607 aa  98.2  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  23.79 
 
 		 423 aa  96.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  24.28 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 		 613 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  24.45 
 
 		 590 aa  95.5  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.47 
 
 		 1162 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 596 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  24.3 
 
 		 474 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 581 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  24.84 
 
 		 449 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 607 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 440 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  22.8 
 
 		 475 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 599 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 563 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  24.84 
 
 		 452 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  25.87 
 
 		 459 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  28.95 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 366 aa  92  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 429 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  24.84 
 
 		 449 aa  92  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 449 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  25.9 
 
 		 360 aa  91.3  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 462 aa  90.9  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  23.67 
 
 		 518 aa  90.5  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 518 aa  90.5  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 		 470 aa  90.5  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.15 
 
 		 425 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  24.33 
 
 		 596 aa  90.5  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 611 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 459 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 459 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 357 aa  89.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 602 aa  89.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 389 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  27.75 
 
 		 372 aa  89  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 462 aa  89  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.08 
 
 		 465 aa  89  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 633 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  26.39 
 
 		 465 aa  89  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 		 496 aa  88.2  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 605 aa  88.2  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3078  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 886 aa  87.8  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  23.7 
 
 		 466 aa  87  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  24.07 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 589 aa  87  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 639 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>