More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2740 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 627 aa  1256    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.86 
 
 		 611 aa  823    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.35 
 
 		 602 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.66 
 
 		 616 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  60.6 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  58.48 
 
 		 616 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.17 
 
 		 607 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  58.48 
 
 		 616 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  60 
 
 		 605 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  59.61 
 
 		 611 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.9 
 
 		 597 aa  601  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.63 
 
 		 599 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.95 
 
 		 563 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.25 
 
 		 581 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.95 
 
 		 601 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.42 
 
 		 566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.82 
 
 		 605 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  53.54 
 
 		 590 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.87 
 
 		 578 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  54.5 
 
 		 589 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  54.33 
 
 		 601 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  54.09 
 
 		 596 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.35 
 
 		 596 aa  568  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 589 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  50.34 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 615 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 564 aa  355  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 559 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 540 aa  303  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 574 aa  299  9e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 577 aa  293  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 549 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 529 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 592 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  43.28 
 
 		 572 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  43.01 
 
 		 572 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 525 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 501 aa  226  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 489 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 538 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 470 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.52 
 
 		 496 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.39 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 458 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 458 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  27.74 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  23.91 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.58 
 
 		 463 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.31 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 421 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 719 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  29.4 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 463 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 463 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 462 aa  115  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  26.01 
 
 		 475 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.01 
 
 		 463 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.01 
 
 		 463 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  31.91 
 
 		 257 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 470 aa  114  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.82 
 
 		 468 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 585 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  30.07 
 
 		 470 aa  114  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  27.68 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.84 
 
 		 456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  26.95 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  26.81 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.87 
 
 		 467 aa  112  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>