More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3336 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3336  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 520 aa  1057    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  40.31 
 
 		 541 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 674 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6329  histidine kinase  39.58 
 
 		 340 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00201026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 526 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 564 aa  113  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  26.94 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  25.35 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 605 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 596 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 607 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  24.04 
 
 		 596 aa  97.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 589 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  25 
 
 		 487 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 563 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  24.74 
 
 		 310 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 627 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 599 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 581 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  27.27 
 
 		 616 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  27.27 
 
 		 616 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 611 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  26.87 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  28.37 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  27.19 
 
 		 458 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  24.91 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 601 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  26.45 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  25.34 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  30.85 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  24.7 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 611 aa  91.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 559 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 616 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  30.8 
 
 		 418 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  25.2 
 
 		 438 aa  90.9  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 484 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 484 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 605 aa  90.1  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  26.63 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  29.93 
 
 		 592 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 500 aa  89.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  24.06 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  24.06 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  25.1 
 
 		 628 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  21.2 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 367 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  24.31 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  24.06 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 592 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  25.83 
 
 		 376 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0166  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  25.45 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  25.99 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  23.85 
 
 		 487 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 376 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 376 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.05 
 
 		 513 aa  87.4  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 640 aa  87.4  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  26.25 
 
 		 423 aa  87.4  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 425 aa  87  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 445 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470796  normal  0.0469893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 		 613 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 444 aa  87  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 491 aa  87  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  25.15 
 
 		 589 aa  86.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 458 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 376 aa  86.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 458 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 487 aa  86.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  24.22 
 
 		 455 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  23.61 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 597 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  25 
 
 		 601 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  24.09 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  26.5 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  28.15 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 641 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>