More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0166 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0166  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.77 
 
 		 428 aa  831    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.1 
 
 		 445 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470796  normal  0.0469893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0192  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.72 
 
 		 450 aa  614  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.65 
 
 		 447 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4831  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0411484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.671579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10920  two component system sensor histidine kinase prrB  43.21 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5010  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.096422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3010  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256903  decreased coverage  0.00400665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2995  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  34.9 
 
 		 471 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5088  histidine kinase  30.93 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  0.274767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  39.09 
 
 		 442 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.79 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 490 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  32.62 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  32.58 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  31.72 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 463 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 586 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  35.76 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 469 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 717 aa  106  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  31.02 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.37 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  29.93 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  32.66 
 
 		 566 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  30.46 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  27.72 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  33.82 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.79 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.3 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.93 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  27.17 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  29.58 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 462 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 524 aa  100  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 491 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 448 aa  99.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  30.56 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  32.49 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 464 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.25 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.45 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  32 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 488 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 452 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 524 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  30.99 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  32.12 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  30.39 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  31.38 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 484 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 461 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>