More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1599 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  869    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  55.8 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  38.94 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 490 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  36.69 
 
 		 523 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 586 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  44.44 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  46.96 
 
 		 480 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.54 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  44.51 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 492 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  34 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.18 
 
 		 447 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  39.64 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  39.3 
 
 		 490 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  46.45 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.29 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  33.48 
 
 		 505 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  32.58 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  40.99 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.12 
 
 		 469 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  37.92 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 522 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 524 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 503 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  33.97 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  32.27 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0754  histidine kinase  41.61 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  38.31 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.13 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  40.83 
 
 		 496 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 495 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 504 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  36.33 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 515 aa  143  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  36.2 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  37.19 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  34.08 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  38.27 
 
 		 466 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  35.49 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.07 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.91 
 
 		 490 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  35.53 
 
 		 508 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  34.9 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.19 
 
 		 461 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  37.37 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  33.44 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  34.9 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  39.22 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  36.49 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 563 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  35.17 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  34.6 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 601 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 524 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  32.99 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  34.31 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  33.33 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  34.71 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  26.13 
 
 		 449 aa  134  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  33.25 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  35.23 
 
 		 413 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  33.25 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>