More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3240 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 464 aa  894    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  83.37 
 
 		 466 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.14 
 
 		 464 aa  887    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  36.76 
 
 		 476 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 		 487 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  34.2 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 469 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  39.22 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 488 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 489 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  35.77 
 
 		 476 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  33.26 
 
 		 469 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 451 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  35.77 
 
 		 476 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  33.26 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  32.83 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 482 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 472 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 467 aa  187  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  41.4 
 
 		 483 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  32.6 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 477 aa  179  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  34.97 
 
 		 499 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 533 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 499 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  34.1 
 
 		 445 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  34.41 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  29.09 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  36.72 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 407 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.62 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  32.19 
 
 		 445 aa  153  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.91 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  41.88 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  30.03 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  30.21 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.91 
 
 		 486 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.22 
 
 		 462 aa  146  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.56 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 418 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 418 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  29.95 
 
 		 418 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>