More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5088 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5088  histidine kinase  100 
 
 		 457 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  0.274767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2995  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3010  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256903  decreased coverage  0.00400665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10920  two component system sensor histidine kinase prrB  31.73 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0411484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.671579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4831  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5010  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 446 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.096422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 447 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0192  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0166  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470796  normal  0.0469893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 505 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 469 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  36.31 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.1 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  35.22 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  37.08 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.62 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  34.75 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 522 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 376 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  31.47 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  31.83 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24.39 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24.39 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.73 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 515 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.33 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 545 aa  99.8  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 478 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  28.91 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  32.04 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  33.47 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  27.1 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2756  ATP-binding region ATPase domain protein  29.75 
 
 		 474 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 616 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 376 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 532 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  30.89 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 532 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 504 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.7 
 
 		 457 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 490 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  33.06 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  31.99 
 
 		 616 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  31.99 
 
 		 616 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  33.06 
 
 		 431 aa  96.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 493 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.32 
 
 		 499 aa  96.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  31.98 
 
 		 431 aa  96.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 615 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 480 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  32.91 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  29.95 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  33.06 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  33.06 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  32.25 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  33.06 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  32.93 
 
 		 506 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 605 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 601 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  30.61 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  33.06 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  33.06 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  33.22 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  33 
 
 		 523 aa  94.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  31.14 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  29.52 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.2 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 585 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 582 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  34.52 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  32.26 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  32.23 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  35.6 
 
 		 510 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>