More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00403 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3609  histidine kinase  82.73 
 
 		 498 aa  783    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708501  normal  0.855271 
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  100 
 
 		 492 aa  984    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.73 
 
 		 498 aa  783    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 449 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  38.73 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  29.96 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  38.73 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  29.96 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  38.95 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  38.95 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  38.95 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  38.95 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  38.95 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 445 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  36.87 
 
 		 442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 456 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  37.58 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  39.23 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.51 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.51 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 433 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.18 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.5 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.57 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 459 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 459 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 458 aa  170  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  35.93 
 
 		 517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 437 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.22 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  35.05 
 
 		 1093 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  31.25 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.16 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.88 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  33.91 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 448 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  38.07 
 
 		 448 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 448 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  36.52 
 
 		 523 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  34.11 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  40.65 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  36.58 
 
 		 505 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  36.58 
 
 		 505 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  36.58 
 
 		 505 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  36.58 
 
 		 505 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 462 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.71 
 
 		 817 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.54 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  36.39 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  30.44 
 
 		 467 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 515 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  36.88 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  34.13 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  32.75 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  33.08 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  37.41 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  39.65 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  35.78 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 474 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 474 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>