More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3911 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 468 aa  958    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 445 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  35.45 
 
 		 438 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 438 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 438 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  30.11 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 467 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.59 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  31.79 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.32 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  35.94 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  30.93 
 
 		 467 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  30.39 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.93 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 458 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.19 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  35.47 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  30.93 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  30.71 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  32.85 
 
 		 1093 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 518 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  27 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  32.4 
 
 		 523 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  32.44 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 519 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 505 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 505 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 505 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  30.39 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.44 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  28.64 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3609  histidine kinase  30.72 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708501  normal  0.855271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  31.1 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  30.29 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 458 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 480 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5522  Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32.4 
 
 		 817 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.29 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.72 
 
 		 499 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 450 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  29.87 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  32.79 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>