More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5522 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5522  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 460 aa  931    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  33.91 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  32.6 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  29.92 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  30.15 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 445 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 448 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 433 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  28.1 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  27.99 
 
 		 438 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  29.48 
 
 		 519 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  35.49 
 
 		 526 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32.93 
 
 		 442 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.95 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 524 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  28.44 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  29.04 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 455 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 455 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  29.13 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.16 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.72 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  29.71 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.58 
 
 		 443 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 515 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  33.15 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.65 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 481 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 523 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  33.24 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.13 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 505 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32 
 
 		 817 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  30.7 
 
 		 468 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  34.16 
 
 		 463 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  27.73 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  32.6 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  30.26 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 515 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  29.52 
 
 		 455 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  30.65 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.25 
 
 		 517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  33.23 
 
 		 517 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.37 
 
 		 509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  28.95 
 
 		 1093 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  27.35 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>