More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4843 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  100 
 
 
405 aa  797    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
464 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  40 
 
 
481 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  38.26 
 
 
442 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
475 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
352 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  30.49 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
586 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  31.27 
 
 
490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
492 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.12 
 
 
457 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
420 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.04 
 
 
472 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  45.49 
 
 
480 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
465 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
522 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
475 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.09 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  34.21 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
422 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
444 aa  133  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0984  sensor histidine kinase CiaH  29.96 
 
 
437 aa  133  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.805926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.41 
 
 
477 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  43.07 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
607 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
515 aa  130  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  35.77 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  29.82 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  32.64 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  29.58 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  28 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  32.96 
 
 
430 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  31.41 
 
 
453 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  32.96 
 
 
430 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  35.59 
 
 
454 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
475 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  38.39 
 
 
506 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
476 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  33.93 
 
 
452 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  31.01 
 
 
392 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  33.97 
 
 
452 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  33.84 
 
 
436 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
416 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  33.97 
 
 
452 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
416 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  33.97 
 
 
452 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
457 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  30.65 
 
 
416 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  28.65 
 
 
439 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  30.65 
 
 
392 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.36 
 
 
463 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
472 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  28.16 
 
 
416 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0754  histidine kinase  37.67 
 
 
427 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  34.1 
 
 
527 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
458 aa  123  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  33.84 
 
 
436 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
585 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  39.24 
 
 
453 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.42 
 
 
1162 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  39.04 
 
 
520 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  36.67 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.91 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  33.47 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  38.22 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  28.31 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  28.31 
 
 
473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
534 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  34.89 
 
 
503 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  40.81 
 
 
483 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
524 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
532 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
532 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
600 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
436 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
633 aa  119  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
590 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  37.61 
 
 
477 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  31.4 
 
 
416 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
469 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  28.52 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
583 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  28.52 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  33.19 
 
 
583 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>