More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1586 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
436 aa  865    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.79 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  53.18 
 
 
475 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  55.13 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.63 
 
 
454 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3210  histidine kinase  48.36 
 
 
515 aa  435  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.625161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  51.56 
 
 
457 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
419 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  43 
 
 
412 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  35.28 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  35.28 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  32.89 
 
 
454 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  32.67 
 
 
454 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  33.48 
 
 
443 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
444 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  32.66 
 
 
427 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
420 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  33.56 
 
 
443 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
454 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
436 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
452 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.45 
 
 
486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  32.26 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  32.95 
 
 
436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
504 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  29.66 
 
 
412 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
416 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
416 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
416 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
416 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  29.66 
 
 
416 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
392 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
509 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  27.68 
 
 
416 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  29.15 
 
 
416 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.42 
 
 
477 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  33.83 
 
 
392 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
459 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
607 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  42.67 
 
 
469 aa  156  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
469 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  30.83 
 
 
336 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
475 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
597 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  36.5 
 
 
527 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
597 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  28.57 
 
 
481 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
585 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
457 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
422 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.04 
 
 
461 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
585 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
591 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
468 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5188  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
482 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  27.16 
 
 
469 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.02 
 
 
486 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
447 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
469 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
456 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.73 
 
 
587 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  37.89 
 
 
429 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
582 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  41.3 
 
 
449 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.28 
 
 
587 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.04 
 
 
587 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
612 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.28 
 
 
587 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.28 
 
 
587 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.28 
 
 
587 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.28 
 
 
587 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  27.91 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.73 
 
 
587 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
590 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  34.46 
 
 
463 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  35.78 
 
 
357 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  34.34 
 
 
436 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  35.68 
 
 
599 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.73 
 
 
587 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  25.9 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
587 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  35.22 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
958 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  36.93 
 
 
477 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
815 aa  140  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  39.19 
 
 
510 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
422 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
444 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  35.34 
 
 
357 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>