More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0101 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
472 aa  892    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  50.15 
 
 
480 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  52.24 
 
 
447 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.82 
 
 
457 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  43.66 
 
 
469 aa  223  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  50.72 
 
 
453 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  44.62 
 
 
455 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
475 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  48.9 
 
 
454 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  36.23 
 
 
490 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 
464 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  47.76 
 
 
450 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  55.72 
 
 
456 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  49.64 
 
 
420 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  37.66 
 
 
476 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  38.08 
 
 
523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  37.32 
 
 
452 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  46.86 
 
 
481 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  38.77 
 
 
505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  45.88 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
586 aa  183  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  45.28 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  38.48 
 
 
469 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  43.12 
 
 
453 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
455 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  40.19 
 
 
508 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  46.67 
 
 
405 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.17 
 
 
477 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  35.82 
 
 
503 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
469 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
484 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
469 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
470 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
459 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
495 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  43.11 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
465 aa  153  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
500 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
524 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  36.2 
 
 
481 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
460 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32 
 
 
462 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
452 aa  150  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  37.18 
 
 
583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  34.25 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
469 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  36.94 
 
 
506 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  27.48 
 
 
452 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  27.48 
 
 
452 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.44 
 
 
490 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  27.41 
 
 
452 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
437 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
478 aa  144  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
462 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  39.73 
 
 
471 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  35.54 
 
 
466 aa  143  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
448 aa  142  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
504 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
491 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204488  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
440 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  36.6 
 
 
520 aa  140  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  29.94 
 
 
436 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  38.57 
 
 
566 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  38.51 
 
 
470 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  30.22 
 
 
457 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
490 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  30.22 
 
 
457 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
487 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
534 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
480 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.85 
 
 
486 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  32.76 
 
 
336 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
377 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  26.46 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  29.63 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  37.96 
 
 
471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
509 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.8 
 
 
469 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
453 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
477 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
479 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
500 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  40.16 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  35.65 
 
 
597 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.51 
 
 
461 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
436 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  29.63 
 
 
436 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
473 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  40.99 
 
 
444 aa  136  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>