More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1611 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 452 aa  867    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  38.27 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  34.98 
 
 		 523 aa  192  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.25 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 492 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 490 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 475 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  40 
 
 		 472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  36.05 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  38.25 
 
 		 453 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 352 aa  164  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.82 
 
 		 457 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  37.99 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  32.38 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  30.95 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 586 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  32.9 
 
 		 490 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  33.26 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  31.98 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  33.26 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.28 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  32.49 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  38.36 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 406 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.72 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  33.11 
 
 		 442 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 495 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  28.78 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  31.3 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 546 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.67 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.47 
 
 		 490 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.92 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.51 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.98 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  29.06 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  35.16 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 536 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 515 aa  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  27.2 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  33.55 
 
 		 592 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  39.02 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  31.27 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  34.46 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  34.63 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 362 aa  120  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  31.58 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 500 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  29.81 
 
 		 379 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  36.75 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  32.44 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  35.23 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.66 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  34.51 
 
 		 558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.32 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  27.93 
 
 		 463 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  34.6 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>