More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5469 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  100 
 
 		 456 aa  879    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  55.56 
 
 		 454 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.52 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.7 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  52.35 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  51.77 
 
 		 476 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  53.87 
 
 		 472 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  45.4 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  44.07 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 		 475 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 352 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  50 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  41.79 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  46.1 
 
 		 455 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  46.49 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 586 aa  178  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  43.73 
 
 		 442 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  41.81 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  44.36 
 
 		 523 aa  170  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 492 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  38.48 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  42.44 
 
 		 481 aa  163  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  37.46 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  35.5 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  32.53 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  34.47 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 463 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 459 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 458 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.46 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  35.56 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  35.62 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  35.45 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  39.44 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35.96 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  28.43 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 455 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 455 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 426 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  32.96 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.55 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.93 
 
 		 461 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  39.16 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  39.16 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  39.16 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  39.16 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  39.16 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  39.78 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  29.86 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  37.72 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  37.14 
 
 		 566 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.15 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  39.16 
 
 		 1093 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0754  histidine kinase  38.26 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  29.74 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  29.63 
 
 		 357 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>