More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3372 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  100 
 
 		 465 aa  882    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.36 
 
 		 447 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  47.68 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  49.41 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  44 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.56 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  37.94 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  44.09 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  40.26 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  37.81 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  38.23 
 
 		 523 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.65 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  39.61 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  43.96 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 492 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  39.22 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 352 aa  137  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  42.13 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  36.45 
 
 		 505 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  37.5 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 438 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 515 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  36.36 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  32.89 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 448 aa  123  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.43 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.62 
 
 		 477 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 513 aa  120  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.41 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  30.7 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 517 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 501 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 575 aa  117  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  33.12 
 
 		 508 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  29.89 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  34.55 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  32.64 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  29.89 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.03 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  34.3 
 
 		 567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  28.88 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.11 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 504 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.15 
 
 		 518 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  32.46 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.89 
 
 		 592 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 557 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  36.69 
 
 		 343 aa  113  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 547 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.73 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  32.42 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  32.43 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  38.25 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  33.85 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  29.63 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  30.77 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  30.13 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>