More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1092 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  894    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0899  Signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218475  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 513 aa  163  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  31.76 
 
 		 497 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  34.02 
 
 		 397 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  35.43 
 
 		 477 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  30.45 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 479 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  34.51 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  35.91 
 
 		 481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1624  sensor histidine kinase CsrS  32.01 
 
 		 501 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0265731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.58 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.77 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  29.1 
 
 		 488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.2 
 
 		 469 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  31.1 
 
 		 454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 429 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  28.78 
 
 		 436 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  31.08 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  32.76 
 
 		 411 aa  136  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  33.77 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  29.22 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  32.71 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.1 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.2 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.99 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 462 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 524 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  27.49 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 619 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  30.3 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 621 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 611 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  26.21 
 
 		 463 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  32.16 
 
 		 613 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.8 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  31.22 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  30.18 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  29.81 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  31.88 
 
 		 506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  27.49 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  27.23 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 597 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  32.26 
 
 		 613 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  32.26 
 
 		 613 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 484 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 608 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  31.8 
 
 		 613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 613 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  31.8 
 
 		 613 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>