More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0702 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  100 
 
 		 523 aa  1014    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  39.92 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 352 aa  213  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  45.94 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.19 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  44.38 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 490 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  34.44 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  34.96 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.5 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  34.13 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  44.64 
 
 		 454 aa  190  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  46.59 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 464 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.67 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  32.68 
 
 		 505 aa  177  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  33.76 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  32.22 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  37.2 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 500 aa  170  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 495 aa  169  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 484 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 477 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 452 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.44 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  37 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 455 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  35.34 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 469 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.1 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 534 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 465 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  38.28 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 532 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 517 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 532 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 500 aa  149  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  33.41 
 
 		 481 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  35.69 
 
 		 328 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  43.97 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 487 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  36.33 
 
 		 478 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  35.88 
 
 		 506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  30.14 
 
 		 471 aa  140  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 509 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.63 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  35.34 
 
 		 515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  35.17 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  31.53 
 
 		 459 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 462 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  36.27 
 
 		 555 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  35.69 
 
 		 456 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.84 
 
 		 1162 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  32.57 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.7 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  35.49 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 498 aa  135  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.14 
 
 		 486 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 537 aa  133  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 472 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 472 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 472 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  27.24 
 
 		 397 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  37.15 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  34.42 
 
 		 508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  36.25 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0754  histidine kinase  37.86 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>