More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1408 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
458 aa  905    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
486 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  29.27 
 
 
497 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.76 
 
 
477 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
468 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
469 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
455 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  37.46 
 
 
583 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
524 aa  153  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
489 aa  153  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
452 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
468 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
468 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
468 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  31.78 
 
 
592 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
487 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32 
 
 
442 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.08 
 
 
486 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  33.22 
 
 
459 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  33.8 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
469 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
458 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  33.75 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
438 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
447 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
450 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  31.53 
 
 
475 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.86 
 
 
469 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  30.02 
 
 
471 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
467 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
464 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
470 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
486 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  36.59 
 
 
443 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
462 aa  144  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  37.32 
 
 
431 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
495 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.74 
 
 
466 aa  143  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.46 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
472 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
477 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  35.51 
 
 
443 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.76 
 
 
457 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
513 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
464 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
471 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
534 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
469 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
463 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
469 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
469 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
469 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
445 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
490 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
471 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
456 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
490 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  29.67 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
502 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
493 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  34.85 
 
 
508 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  34.92 
 
 
523 aa  134  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
489 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
486 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  33.21 
 
 
455 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
500 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
477 aa  133  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
440 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.37 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.45 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.21 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  37.89 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  35.52 
 
 
488 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  29.58 
 
 
471 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
463 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  34.78 
 
 
478 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
469 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
466 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
465 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>