More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0309 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 474 aa  917    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.9 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.21 
 
 		 524 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49 
 
 		 500 aa  279  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 479 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 522 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 503 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 473 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  37.87 
 
 		 477 aa  256  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  36.89 
 
 		 520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  44.17 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 529 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 502 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  40.37 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  39.83 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  40.82 
 
 		 488 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 488 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  40.85 
 
 		 483 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  42.37 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  43 
 
 		 486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  38.38 
 
 		 496 aa  232  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 505 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 612 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 528 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 509 aa  226  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  43.94 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 517 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  36.18 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  38.38 
 
 		 540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  46.28 
 
 		 550 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  36.86 
 
 		 477 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  43.65 
 
 		 505 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  35.87 
 
 		 471 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 		 468 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 552 aa  209  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 635 aa  204  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  39.31 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  39.73 
 
 		 497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  36.67 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  37.45 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 510 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  35.22 
 
 		 503 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  38.32 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5254  histidine kinase  35.22 
 
 		 545 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  39.37 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  39.12 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  31.33 
 
 		 648 aa  194  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  35.73 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 546 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  38.21 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  43.1 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 480 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 526 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.17 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 438 aa  166  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 504 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 504 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 509 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.15 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.43 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  30.7 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 470 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  34.24 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  32.64 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 480 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 639 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>