More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0230 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  937    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.22 
 
 		 475 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  57.23 
 
 		 527 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 403 aa  200  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  30.23 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  30.23 
 
 		 416 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  33.53 
 
 		 416 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  33.53 
 
 		 416 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  35.77 
 
 		 486 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  33.53 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  40.97 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  38.41 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  38.53 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  34.02 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  33.53 
 
 		 392 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  35.9 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  34.81 
 
 		 430 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 600 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  34.23 
 
 		 511 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 597 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 585 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 		 587 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  34.4 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 604 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  32.98 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 592 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.51 
 
 		 587 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.51 
 
 		 587 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.51 
 
 		 587 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.51 
 
 		 587 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.79 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  39.46 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  39.46 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.45 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  39.46 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 470 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 461 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 585 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  40.77 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  40.18 
 
 		 496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  39.29 
 
 		 463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 607 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.16 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  35.32 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  35.32 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  30.18 
 
 		 336 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  28.24 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 597 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  28.24 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  38.12 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  37.95 
 
 		 456 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1659  histidine kinase  37.84 
 
 		 594 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350157  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  36.36 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  37.67 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  35.17 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 582 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 584 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  34.88 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 815 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  34.08 
 
 		 427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  34.01 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 584 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  42.53 
 
 		 537 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  27.66 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  34.01 
 
 		 454 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 590 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 473 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 589 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 471 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  36.49 
 
 		 455 aa  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  37.22 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 475 aa  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 367 aa  153  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  39.91 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>