More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4536 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4831  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
448 aa  884    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10920  two component system sensor histidine kinase prrB  82.29 
 
 
446 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
448 aa  884    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.671579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
448 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0411484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  81.21 
 
 
447 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5010  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.25 
 
 
446 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.096422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.9 
 
 
454 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.22 
 
 
454 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3010  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.9 
 
 
451 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256903  decreased coverage  0.00400665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2995  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.9 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.9 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 
445 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470796  normal  0.0469893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0166  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 
445 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
428 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0192  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
450 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
447 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  37.22 
 
 
471 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
504 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5088  histidine kinase  33.01 
 
 
457 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  0.274767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
352 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  29.71 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.9 
 
 
469 aa  119  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  27.94 
 
 
524 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  31.78 
 
 
476 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
675 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.51 
 
 
503 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  32.4 
 
 
454 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  28.72 
 
 
498 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  31.39 
 
 
468 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  30.72 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
482 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
498 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  35.48 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
532 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
532 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
517 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  35.13 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
482 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  32.49 
 
 
566 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  31.93 
 
 
517 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.19 
 
 
486 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
488 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  31.62 
 
 
480 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
531 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  32.75 
 
 
478 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  30.94 
 
 
506 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
501 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
448 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
438 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  29.24 
 
 
438 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
475 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
446 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
484 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
484 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  33.44 
 
 
508 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
484 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
462 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.71 
 
 
518 aa  106  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
515 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
469 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.32 
 
 
463 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  31.33 
 
 
490 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
468 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
515 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
456 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
469 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
458 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
449 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  31.37 
 
 
462 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  33.94 
 
 
480 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
462 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
445 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
717 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
458 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
483 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.33 
 
 
515 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.97 
 
 
447 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
491 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204488  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.22 
 
 
492 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
490 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
461 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
462 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  31.45 
 
 
468 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  25.24 
 
 
458 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
456 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
601 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
447 aa  103  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
453 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
445 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  35.07 
 
 
398 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
517 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>