More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4885 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.63 
 
 		 376 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  94.68 
 
 		 376 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  92.55 
 
 		 376 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 376 aa  752    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.2 
 
 		 376 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  92.55 
 
 		 376 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  92.82 
 
 		 376 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  77.96 
 
 		 371 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0816  sensor histidine kinase  77.96 
 
 		 401 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0845  sensor histidine kinase  77.96 
 
 		 472 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2192  sensor histidine kinase  77.96 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0938  sensor histidine kinase  77.96 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1590  sensor histidine kinase  77.96 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0033  sensor histidine kinase  77.96 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  44.33 
 
 		 478 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  37.93 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  37.54 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  38.23 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  38.41 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 523 aa  186  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  38.64 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  38.64 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  38.64 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  38.31 
 
 		 433 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  38.31 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  36.99 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  36.99 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  36.99 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  36.64 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  38.93 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  38.93 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  36.3 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  36.3 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  36.3 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  36.3 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  36.3 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 428 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 563 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0676  histidine kinase  36.11 
 
 		 400 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.887775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  36.64 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  36.43 
 
 		 435 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  34.24 
 
 		 429 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 546 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  34.02 
 
 		 451 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  34.35 
 
 		 561 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 536 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.72 
 
 		 561 aa  163  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 535 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  35.14 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.91 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 550 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  38.3 
 
 		 442 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  37.94 
 
 		 442 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  37.94 
 
 		 442 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  37.94 
 
 		 442 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 536 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 429 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  37.94 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  37.94 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  37.94 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  32.62 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0627622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  35.97 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 469 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  32.27 
 
 		 437 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0680  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 433 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 464 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  33.69 
 
 		 485 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 448 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.44 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 535 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  35.36 
 
 		 538 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  41.33 
 
 		 755 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 760 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  33.1 
 
 		 452 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  33.58 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  32.44 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  31.99 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  31.06 
 
 		 440 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3205  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 432 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 422 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605909  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000601412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  31.03 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2316  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>