More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  100 
 
 		 340 aa  692    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  58.1 
 
 		 319 aa  345  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2867  histidine kinase  59.73 
 
 		 305 aa  337  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 600 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 932 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 585 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  29.57 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 621 aa  155  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  35.5 
 
 		 463 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.29 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.21 
 
 		 587 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 		 587 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 		 587 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 		 587 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.82 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 		 587 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.82 
 
 		 587 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 460 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.82 
 
 		 587 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 456 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 587 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.74 
 
 		 496 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 493 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 581 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 815 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  33.33 
 
 		 518 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  37.44 
 
 		 501 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 607 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.54 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  36.49 
 
 		 598 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.55 
 
 		 463 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 453 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 585 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 592 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  34.48 
 
 		 456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 458 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 412 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  37.04 
 
 		 537 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 945 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  33.22 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 582 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 571 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  32.48 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 461 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 496 aa  143  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  39.82 
 
 		 591 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  28.74 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 623 aa  143  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 484 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  30.99 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  30.99 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  32.87 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  31.97 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.25 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 609 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.46 
 
 		 906 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  27.95 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 594 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  34.3 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  27.79 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  40.42 
 
 		 485 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  31.9 
 
 		 599 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 590 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  32.49 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 489 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  35.53 
 
 		 919 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 477 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 480 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 452 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 608 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 504 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>