More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6329 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6329  histidine kinase  100 
 
 		 340 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00201026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.06 
 
 		 335 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 		 674 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  41.45 
 
 		 541 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3336  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 520 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 526 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  34.52 
 
 		 476 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 538 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 605 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  29.62 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 457 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  28.73 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  27.94 
 
 		 351 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  33.77 
 
 		 591 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  29.01 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  32.9 
 
 		 616 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  32.9 
 
 		 616 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 614 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  29.1 
 
 		 475 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 616 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 463 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 491 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 601 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.67 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  33.98 
 
 		 475 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.39 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 607 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 563 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 453 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 481 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29.12 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 611 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  32 
 
 		 555 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 815 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 556 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 471 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 463 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.33 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 463 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.72 
 
 		 503 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  31.15 
 
 		 478 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.08 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 611 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 596 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 473 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 484 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  29.24 
 
 		 487 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 484 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  31.56 
 
 		 599 aa  99.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 463 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  33.08 
 
 		 483 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  33.08 
 
 		 483 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  33.08 
 
 		 483 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  26.2 
 
 		 451 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  32.05 
 
 		 598 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 451 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  31.3 
 
 		 575 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.74 
 
 		 587 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 578 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 462 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.45 
 
 		 461 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  32.24 
 
 		 596 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 566 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 524 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.74 
 
 		 587 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 408 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  25.26 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 408 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 458 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 641 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 581 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 601 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  28.34 
 
 		 484 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.16 
 
 		 587 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>