More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0965 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
628 aa  1288    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  32.92 
 
 
478 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  33.92 
 
 
477 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  32.57 
 
 
478 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  33.75 
 
 
474 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  34.69 
 
 
473 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  33.57 
 
 
474 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  33.02 
 
 
483 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  33.02 
 
 
483 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  33.02 
 
 
483 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  33.4 
 
 
483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  32.96 
 
 
481 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  32.22 
 
 
472 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  32.65 
 
 
481 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  31.74 
 
 
481 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  31.65 
 
 
474 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  33.77 
 
 
472 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  32.02 
 
 
474 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.861306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  31.84 
 
 
474 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  31.84 
 
 
474 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  31.84 
 
 
474 aa  249  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  31.84 
 
 
474 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  31.84 
 
 
474 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  32.34 
 
 
474 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  32.34 
 
 
474 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  32.21 
 
 
474 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  32.21 
 
 
474 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  32.08 
 
 
477 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  32.08 
 
 
477 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  31.52 
 
 
472 aa  240  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  30.83 
 
 
474 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  30.45 
 
 
474 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  30.45 
 
 
474 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  30.45 
 
 
474 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  30.08 
 
 
474 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  28.79 
 
 
486 aa  226  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  30.83 
 
 
475 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  29.62 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  30.51 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  32.44 
 
 
477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  29.08 
 
 
465 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  28.44 
 
 
494 aa  203  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  29.57 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  28.95 
 
 
480 aa  193  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
476 aa  190  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  31.28 
 
 
239 aa  123  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  22.82 
 
 
616 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  22.82 
 
 
616 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
616 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 
639 aa  104  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
538 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  22.08 
 
 
463 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 
639 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 
601 aa  100  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  21.72 
 
 
456 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
465 aa  99.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 
639 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 
614 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
613 aa  99  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.22 
 
 
641 aa  98.2  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  22.62 
 
 
455 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  22.62 
 
 
455 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  21.83 
 
 
463 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.72 
 
 
614 aa  97.8  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  21.83 
 
 
463 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  21.07 
 
 
463 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.16 
 
 
640 aa  97.1  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
592 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
457 aa  96.3  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
461 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  21.32 
 
 
463 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
493 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  21.83 
 
 
462 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
599 aa  95.1  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  21.17 
 
 
463 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 
463 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  21.83 
 
 
461 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
484 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
484 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  22.12 
 
 
481 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  21.17 
 
 
463 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
487 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
487 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
381 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
487 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
418 aa  92  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 
605 aa  92  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
480 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
487 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
484 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
917 aa  91.3  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  21.81 
 
 
484 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
478 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 
361 aa  90.9  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3336  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
520 aa  90.9  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  27.92 
 
 
537 aa  90.5  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 
463 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
438 aa  90.1  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 
462 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
465 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>