More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5195 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  73.09 
 
 		 473 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  70.13 
 
 		 477 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 		 472 aa  949    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  70.13 
 
 		 474 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  71.88 
 
 		 478 aa  656    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  71.61 
 
 		 474 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  72.09 
 
 		 478 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  51.38 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  51.8 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  48.75 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  48.75 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  48.75 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  48.54 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  49.26 
 
 		 481 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  49.13 
 
 		 472 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  45.97 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  45.97 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  45.76 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  46.11 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  45.76 
 
 		 474 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  45.76 
 
 		 474 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  45.76 
 
 		 474 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  45.76 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  45.34 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  45.07 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  45.17 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  44.86 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  45.07 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  45.07 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  45.45 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  45.45 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  45.24 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  45.68 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  44.19 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  44.35 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  39.87 
 
 		 475 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  43.76 
 
 		 465 aa  359  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  44.76 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  42.09 
 
 		 483 aa  332  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  40.41 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  40.3 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  40.43 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  39.38 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  32.22 
 
 		 628 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  40.62 
 
 		 239 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  28.42 
 
 		 616 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  28.42 
 
 		 616 aa  124  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 616 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  26.09 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  26.94 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  25.59 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  25.59 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  25.59 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 458 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  23.28 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  23.4 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  25.19 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.37 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.09 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  25.53 
 
 		 466 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 466 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  23.39 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  25.8 
 
 		 466 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 639 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  25.8 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  25.51 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 418 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  22.96 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 958 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  22.17 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  23.59 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  22.82 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  22.82 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 487 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 845 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  32.38 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  23.26 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  22.84 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  23.26 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  23.47 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>