More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2062 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
358 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  67.23 
 
 
360 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2144  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  70 
 
 
380 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00653947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  68.9 
 
 
363 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.06 
 
 
381 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0982529  normal  0.120585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.59 
 
 
408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.52 
 
 
335 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.227258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.34 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
389 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00426594  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2464  ATPase domain-containing protein  47.76 
 
 
342 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
546 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
534 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
556 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
489 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
701 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
892 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
725 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
621 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
597 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
453 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.65 
 
 
1629 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
484 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
874 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
607 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
885 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
718 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
473 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
594 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
597 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
815 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
758 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
571 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
2161 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
418 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
612 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
695 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.41 
 
 
617 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
423 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  30.79 
 
 
762 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
425 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
590 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0127  Osmosensitive K+ channel histidine kinase-like protein  30.81 
 
 
640 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
1002 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
611 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
612 aa  125  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
905 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
763 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
591 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
1039 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
585 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  26.61 
 
 
688 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
754 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  34.45 
 
 
470 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  35.68 
 
 
393 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  26.52 
 
 
613 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
755 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
404 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  30.43 
 
 
827 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  26.52 
 
 
613 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
589 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
498 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
902 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
900 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.08 
 
 
599 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
2153 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  26.52 
 
 
613 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
621 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
458 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
613 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
613 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  31.15 
 
 
463 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  26.52 
 
 
613 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
590 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  26.52 
 
 
613 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  25.97 
 
 
613 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  26.24 
 
 
613 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
593 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
342 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  26.23 
 
 
685 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
609 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
461 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
608 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
599 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
588 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
590 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  27.37 
 
 
689 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
907 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
621 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>