More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2312 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 549 aa  1068    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 1010 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 625 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  40.33 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  40.33 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  40.33 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 589 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 408 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 581 aa  160  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  44.14 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 650 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 782 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 764 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 682 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 768 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 768 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1611 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 519 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  29.7 
 
 		 790 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 911 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 600 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1578 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  35.71 
 
 		 572 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 781 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  39.75 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 768 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 799 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  42.49 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1363 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 769 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 569 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 546 aa  151  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1207 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  29.71 
 
 		 771 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 633 aa  150  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1058 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 769 aa  150  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 957 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 		 768 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 933 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 1042 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1322 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  36.67 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 569 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  39.67 
 
 		 927 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  38.33 
 
 		 370 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 631 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 678 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 		 770 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  40.32 
 
 		 676 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 446 aa  147  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 646 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  40.96 
 
 		 1131 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 473 aa  146  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  37.28 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  37.28 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 827 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  37.28 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  37.28 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.75 
 
 		 1514 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  29.71 
 
 		 771 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 774 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  37.28 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 1291 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  37.28 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  37.28 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 		 1480 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 733 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 1516 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 1075 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 881 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 1039 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 939 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  33.68 
 
 		 762 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.84 
 
 		 587 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 1002 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 608 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 634 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 880 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 770 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 		 1002 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 878 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.77 
 
 		 923 aa  144  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 556 aa  144  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.84 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  38.87 
 
 		 519 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 786 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 772 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.42 
 
 		 537 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>