More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1010 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  100 
 
 		 572 aa  1172    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  42.65 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  39.96 
 
 		 582 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  39.12 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  38.45 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 546 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  29.72 
 
 		 534 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.94 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  32.14 
 
 		 835 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  31.03 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  42.59 
 
 		 1170 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 858 aa  179  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  41.18 
 
 		 1172 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  32.2 
 
 		 629 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  28.1 
 
 		 800 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 827 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  35.57 
 
 		 1133 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 646 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1159 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  37.63 
 
 		 1361 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1155 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1362 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1155 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 		 1142 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1161 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1177 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 1163 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1155 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  33.33 
 
 		 932 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  31.82 
 
 		 910 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1149 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.06 
 
 		 932 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  37.88 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 		 823 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1168 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  33.05 
 
 		 925 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1145 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  33.14 
 
 		 925 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 916 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1162 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 977 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 614 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  35.27 
 
 		 1196 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 371 aa  157  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1356 aa  157  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  31.55 
 
 		 910 aa  157  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 817 aa  156  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.3 
 
 		 906 aa  156  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 930 aa  156  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1137 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.14 
 
 		 950 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  32.34 
 
 		 508 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 780 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 1352 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 573 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1195 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.05 
 
 		 952 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 639 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 628 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 1297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  35.31 
 
 		 1137 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 631 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.55 
 
 		 930 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 763 aa  154  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.55 
 
 		 921 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1037  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 793 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.78 
 
 		 461 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 1037 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 919 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.98 
 
 		 929 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1479 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 627 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 456 aa  153  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  35.4 
 
 		 922 aa  153  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.49 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 932 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.44 
 
 		 833 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.49 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  35.28 
 
 		 614 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.96 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.49 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 569 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.49 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.78 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 		 918 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 917 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.49 
 
 		 918 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 		 929 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  37.01 
 
 		 736 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 974 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>